Tips para diseñar un primer – Promotora Garibay SA de CV

Tips para diseñar un primer

  • Los primers deberán "rodear" a la secuencia deseada, de tal manera que queden entre ella y no pierdan bases de la selección.

 

  • Los primers están por lo general entre los 18-25 pares de bases
  • Cada primer deberá tener una Tm entre 55-65°C y un contenido de G/C del 50-60%
  • Cada primer deberá tener un extremo 3’ que hibridice bien con la secuencia molde (template)
  • Los primers no deberán formar dimeros o “hairpins” (estructuras secundarias en las que se pliega el oligo sobre si mismo)

 

Links útiles para el diseño de primers:
http://primer3.ut.ee/
https://toptipbio.com/free-primer-design-programs/

http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi

https://www.genscript.com/tools/pcr-primers-designer
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/