Tips para diseñar un primer

• Los primers deberán "rodear" a la secuencia deseada, de tal manera que queden entre ella y no pierdan bases de la selección.

• Los primers están por lo general entre los 18-25 pares de bases
• Cada primer deberá tener una Tm entre 55-65°C y un contenido de G/C del 50-60%
• Cada primer deberá tener un extremo 3’ que hibridice bien con la secuencia molde (template)
• Los primers no deberán formar dimeros o “hairpins” (estructuras secundarias en las que se pliega el oligo sobre si mismo)

http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi

https://www.genscript.com/tools/pcr-primers-designer
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/