Las proteínas están compuestas por polímeros de amino ácidos. Son 20 aminoacidos de los más comunes en las proteínas y estos son alfa amino ácidos. Tienen un grupo carboxilo y un grupo amino unido en el mismo atomo de carbono (el carbono alfa). Difieren uno del otro en sus cadenas laterales (el grupo R), el cual varía en estructura, tamaño, y carga eléctrica, lo cual influye en la solubilidad de los aminoácidos en el agua.
Clasificación
Los aminoácidos pueden ser agrupados por las propiedades químicas de su grupo R, en particular por su polaridad o su tendencia a interactuar con agua a un pH biológico (cercano a pH 7.0). La polaridad de los grupos R varia ampliamente, desde no polar e hidrofóbico (insolubles en agua) hasta altamente polar e hidrofilíco (soluble en agua.)
Grupos R no polares, alifáticos.
Los grupos R en estos aminoácidos son no polares e hidrofóbicos. Las cadenas laterales de alanina, valina, leucina e isoleucina tienden a aglomerarse entre ellos dentro de una proteína, de esta manera estabilizan la estructura de la proteína mediante interacciones hidrofóbicas. La glicina es la estructura más simple, aunque es no polar, su muy pequeña cadena lateral no contribuye realmente a las interacciones hidrofóbicas. La metionina es uno de los dos aminoácidos que contiene azufre, tiene un grupo tioeter no polar en su cadena lateral. La Prolina tiene una cadena lateral alifática con una estructura cíclica distintiva, este grupo imino mantiene una conformación rígida que reduce la flexibilidad estructural de las regiones polipetídicas que contengan prolina.
Grupos R Aromáticos
Fenilalanina, tirosina y triptofano, con sus cadenas aromáticas son relativamente no polares (hidrofóbicas). El grupo hidróxilo (-OH) de la tirosina puede formar puentes de hidrógeno, lo cual lo vuelve un grupo funcional importante en algunas enzimas. La tirosina y el triptofano son significativamente más polares que la fenilalanina, debido a que el grupo hidroxilo de la tirosina y el nitrogeno del anillo indol del triptofano. El triptofano, tirosina y en menor medida la fenilalanina absorben luz ultravioleta.
Esto explica el porque las proteínas absorben fuertemente la luz a una longitud de onda de 280 nm, una propiedad utilizada para la caracterización de proteínas.
Grupos R polares, sin carga
Estos grupos R contienen grupos funcionales que forman puentes de hidrogéno con el agua, lo cual los vuelve más solubles en agua o hidrofilicos. La polaridad de la serina y treonina esta dada por su grupo hidroxilo (-OH), el de la cisteína por su grupo sulfhidrilo (-SH) y los de la asparagina y glutamina por sus grupos amida. La cisteína es oxidada para formar un aminoácido dimérico unido covalentemente llamado cistina, en el cual dos moléculas de cisteína son unidas por un grupo disulfuro.
Los aminoácidos unidos por enlaces disulfuro son fuertemente hidrofóbicos. Estos enlaces tienen un rol especial en la estructura de muchas proteínas, formando enlaces covalentes entre las partes de una proteína o entre dos cadenas polipéptidicas.
Grupos R con carga positiva (Básicos)
Los grupos R más hidrofilicos son aquellos que ya sea que tengan carga positiva o negativa. Los aminoácidos en los cuales el grupo R tiene una carga positiva significativa a pH 7.0 son lisina, el cual tienen un grupo amino primario en la posición epsilón de su cadena alifática, la arginina la cual tiene un grupo con carga positiva de guanina y la histidina la cual tiene un grupo imidazol. La histidina es el único aminoácido común que tienen un lado ionizable con un pKa cercano a la neutralidad. En muchas reacciones enzimáticas, la histidina facilita la reacción ya que sirve como donador/aceptor de protones.
Grupos R con carga negativa (ácidos)
Los dos aminoácidos que tienen grupos R con una carga negativa a pH 7.0 son aspartato y glutamato, cada uno de los cuales tiene un grupo secundario carboxilo.
]]>
El buffer de fosfatos es altamente soluble en agua y tiene una alta capacidad de amortiguación, pero inhibirá la actividad enzimática y precipitará en etanol. Es uno de los más empleados en biología celular y molecular, en química, ciencia de materiales entre otros
Reactivos
Fosfato de sodio dibásico heptahidratado (Na2HPO4•7H2O)
Fosfato de sodio monobásico anhidro (NaH2PO4)
Equipo
Vasos de precipitado
Probetas
Plato caliente/termoagitador (opcional)
Balanza
Espátulas
Agitador
Platillos de pesaje
Metodología
La polaridad es una propiedad física de los compuestos la cual se relacionan con otras propiedades físicas tales como puntos de fusión, ebullición, solubilidad e interacciones moleculares entre las moléculas.
]]>La polaridad es una propiedad física de los compuestos la cual se relacionan con otras propiedades físicas tales como puntos de fusión, ebullición, solubilidad e interacciones moleculares entre las moléculas. Para la mayoría de los casos hay una correlación directa entre la polaridad de una molécula y el número y tipos de enlaces polares y no-polares covalentes que estén presentes.
Polaridad - Dipolo
La polaridad resulta de la distribución desigual de las cargas de las partículas entre varios atomos de un compuesto. Átomos como el nitrógeno, oxígeno y halógenos que son más electronegativos tienden a tener una carga parcial negativa. Átomos como el carbono e hidrógeno tienen una tendencia a ser neutros o tener una carga parcial positiva. Los electrones en un enlace polar covalente están distribuidos inequitativamente entre dos atomos enlazados, lo cual resulta en cargas parciales negativas y positivas. La separación de cargas parciales crea un dipolo. Una molécula polar resulta cuando una molécula contiene enlaces polares en un arreglo asimétrico.
Polaridad de los solventes más usados
(ordenados del menos al mas polar)
Disolvente | Punto ebullición °C | Densidad |
Éter de petróleo | 35 - 60°C | 0.640 |
Hexano | 69°C | 0.659 |
Tolueno | 110°C | 0.865 |
Benceno | 80°C | 0.874 |
Éter | 35°C | 0.706 |
Tetracloruro de carbono | 77°C | 1.604 |
Cloroformo | 61°C | 1.492 |
Cloruro de Metileno | 40°C | 1.325 |
Acetato de Etilo | 77°C | 0.902 |
Acetona | 56°C | 0.791 |
Etanol | 78°C | 0.785 |
Metanol | 65°C | 0.791 |
Agua | 100°C | 1.000 |
]]>
1. Limpia a detalle, seque, arme y pese el picnometro vació, anote el peso
2. Llene con agua destilada recién hervida a la temperatrua un grado o dos debajo de la temperatura de determinación.
3. Inserte el termometro en la botella, forzando al agua a salir por el tubo de escape.
4. Coloque en un baño con temperatura constante, cuando la temperatura sea alcanzado, limpie con un paño el exceso de agua de la punta del tubo de escape y tape.
5. Quitar del baño, secar, volver a pesar y anotar peso.
6. La diferencia de pesos es aquella del agua en el matraz - el volumen del picnometro a ser calculado,
7. Repita el proceso con un liquído de una gravedad específica desconocida y anote la difrencia de pesos.
Calculo:
Gravedad específica = (peso del líquido de G.E. desconocida)
____________________________________
(peso del agua a la misma temperatura)
]]>
Links útiles para el diseño de primers:
http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi
https://www.genscript.com/tools/pcr-primers-designer
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/
Nombre |
Descripción | Imagen | Productos |
Mortero | Utilizado para moler ingredientes en una pasta fina. Por lo general de porcelana, existen de cristal y agata. |
Mortero de porcelana |
|
Cápsulas | Sirve para evaporación, carbonización de sustancias, es resistente a altas temperaturas |
Cápsula de porcelana económica |
|
Crisoles | Los crisoles son contenedores utilizados para calentar, fundir y mezclar sustancias y compuestos en altas temperaturas o que sean corrosivos. Pueden estar hechos de porcelana, aluminio, vidrio, cuarzo, niquel, acero, teflón entre otros. De forma alta, baja, porosos, y otros. |
Crisol de porcelanaCrisol de aluminioCrisol de Fierro |
|
Soporte universal | Versátil soporte con base de hierro para soportar cristalería, pinzas y otros objetos. Tienen diferentes formas, largos de varilla y capacidades. |
Soporte varilla 45 cmSoporte varilla 50 cmSoporte varilla 60 cmSoporte placa pesada varilla 90 cmSoporte base tripieSoporte base "H" |
|
Mecheros | Los mecheros permiten tener una fuente de calor controlada en el laboratorio. Consta de una entrada de gas (controlada mediante una válvula de aguja, o sin regulador en los modelos más sencillos), una entrada de aire y un tubo de combustión. El tubo de combustión está atornillado a una base por donde entra el gas combustible a través de un tubo de goma, con una llave de paso que permite abrir o cerrar el flujo de gas. Presenta dos orificios ajustables para regular la entrada de aire. Los hay de diversos tipos y acabados. |
Mechero bunsen sencilloMechero bunsen doble cilindroMechero fisher alta temperaturaMechero tipo tirril
|
|
Tela de alambre | Esta malla permite calentar vasos de precipitado y otros artículos de vidrio sin exponerlos directamente el fuego y permitir una adecuada transferencia de calor. Pueden tener centro de cerámica, asbesto y metal. | ||
Gradillas | Utilizadas para sostener tubos de diversos tamaños. | ||
Tubos | Utilizados para realizar pequeñas reacciones, calentar y contener sustancias, realizar cultivos | ||
Pinzas | Para sostener materiales diversos a soportes. Los hay de diferentes tipos dependiendo del tipo de material a sostener | ||
Balanza | Instrumento de medición que se utiliza para determinar la masa de un cuerpo usando la acción de la gravedad sobre ese cuerpo. | ||
Horno | Son utilizados para secado de muestras, secado, evaporado, deshidratado y otros usos. | ||
Incubadoras | Las incubadoras proveen un ambiente controlado, seguro y confiable para trabajar con cultivos celulares ya que permiten regular condiciones como temperatura, humedad, CO2 | ||
Mufla | Es utilizada cuando se requieren altas temperaturas. como en la determinación de cenizas | ||
Potenciometros | Un potenciómetro es el dispositivo que se utiliza para medir la diferencia de potencial existente entre un electrodo de trabajo y uno de referencia, cuando ambos están sumergidos en una solución de la cual se desea determinar su acidez o basicidad, expresando esta como pH. | ||
Autoclave | Estas son usadas para esterilizar instrumentos y medios a altas temperaturas y presión | ||
Campana de extracción | Utilizada para trabajar con reactivos peligrosos en condiciones seguras y controladas | ||
Campana flujo laminar | Utilizada para trabajar en condiciones estériles o limpias. Tiene filtros HEPA y flujos de aire que mantiene condiciones estériles |
Clase A: Estos son instrumentos preferidos para determinaciones volumétricas, normalmente hechos con borosilicato, compatibles con ISO 9000, mayor resistencia química y térmica, se pueden considerar confiables hasta 2 lugares después del punto decimal (0.001). Regularmente se pueden entregar con certificado de trazabilidad.
Clase B: Son instrumentos de propósito general con el mismo diseño básico que la clase A, sin embargo las tolerancias volumétricas son del doble que la clase A, a menos que se indique lo contrario.
]]>El material de laboratorio se puede dividir en dos categorías:
Cristalería volumétrica: Son materiales diseñados para medir, contener y/o entregar volúmenes precisos. Estos materiales se recomienda para análisis gravimétricos o titulaciones así como para preparar las soluciones molares, normales y porcentuales lo cual añadirá exactitud en sus experimentos. Estos materiales no se deben calentar o perderán su calibración debido a efectos de expansión térmica. Se clasifican en clase "A" o clase "B". Algunos ejemplos son: pipetas matraces volumétricos (aforados), probetas, picnometros, buretas
Cristalería no volumétrica: Elementos que se usan para calentar, medir volumenes, precipitar, mezclar, esterilizar, entre otros usos. Ejemplos de ello serían matraces erlenmyer, probetas, vasos de precipitado, matraz de fondo redondo y muchos más. Esta cristalería esta hecha por lo general de vidrio de borosilicato 3.3 de alta durabilidad y resistencia térmica.
Nombre | Descripción | Imagen | Producto |
Vaso de precipitado | Añada y mezcle ingredientes de manera sencilla. Decantar sobrenadantes, contener desechos. Precipite y observe cambios de sustancia, volumen, consistencia, olor, color y forma con un vaso de precipitado. Se puede calentar en el fondo mediante una tela de alambre con centro de cerámica/asbesto. |
Vaso KimaxVaso GlasscoVaso Reforzado |
|
Matraz Erlenmeyer | Agite y mezcle de manera segura con un matraz erlenmyer. Caliente líquidos previniendo perdidas por evaporación |
Matraz Erlenmeyer KimaxMatraz Tapón RoscaMatraz Erlenmeyer GlasscoMatraz Erlenmeyer Pyrex |
|
Matraz Volumétrico (Aforado) | Los matraces volumétricos son utilizados para preparar estándares o diluir una muestra. La mayoría de los matraces son calibrados para contener (TC) un volumen dado de líquido. |
Matraz volumétrico, "B", con tapa tipo snap KIMAXMatraz volumétrico, "A" tapón vidrio KIMAXMatraz volumétrico "A" tapón polietileno KIMAX
|
|
Probeta | La probeta es el segundo instrumento más preciso para calcular, vaciar, medir volumenes y/o fracciones. Las probetas pueden servir para contener (TC) o entregar (TD) volumenes. Pueden ser base de plástico o vidrio. Hay de uso general, clase "A" y clase "B" | ||
Pipeta | Es el instrumento más precios para medir volumenes, por lo general de medidas bajas (de 0.1 a 10 mL). Pueden ser de medición (graduadas y serológicas) o volumétricas. Se requiere un bulbo para su uso. | ||
Bureta | Sirve para dispensar líquidos con precisión, particularmente durante las titulaciones. Esta graduada para medir el volumen de líquido dispensado, y la entrega se controla mediante una válvula. Pueden ser manuales, rectas, volumétricas (clase "B" y clase "A"), automáticas y con reservorio. | ||
Matraz Ebullición (Fondo redondo o fondo plano, florencia, matraz bola) |
Uselo para ebullición, calentar líquidos, destilar, contener reacciones químicas, en rotavapores para recibir destilado o separación. Utilice perlas de vidrio. Los de fondo plano se utilizan con parrilla o tela de alambre con centro de cerámica/asbesto. El fondo redondo permite un calentamiento del líquido más uniforme. Conserve una temperatura óptima en toda la zona del líquido a reaccionar. La forma de este matraz es más resistente a fracturas cuando se trabaja con vacío. En matraces de fondo redondo se recomienda utilizar mantillas de calentamiento |
||
Matraz Destilación (Engler) | Matraz para destilaciones estándar o calentamiento, se adapta fácilmente a cualquier equipo con ayuda de un tapón de hule. Normalmente utilizado para determinar la volatilidad de productos de petroleo | ||
Vidrio de Reloj | Para evaporar líquidos. Reserve polvos corrosivos y cristales. Coloque una tapa de vidrio a un vaso de precipitado. Observe cambios físicos con un vidrio de reloj. Vidrio neutro. | ||
Frasco para reactivos | Para uso general en laboratorio, incluyendo mezclado, almacenamiento, transporte de medio de cultivo, químicos o solventes. Resistente a esterilización por autoclave. | ||
Tubo de ensayo | Para conservar muestras, realizar pequeñas reacciones exotérmicas, gracias a su resistencia al calor y químicos corrosivos. Su fondo esférico y lados verticales reducen pérdida de masa cuando son vaciados. | ||
Condensador (Refrigerante) | Este instrumento es utilizado para hacer un cambio de estado físico de una sustancia, de un estado gaseoso a líquido. Esta diseñado para que un flujo de vapor pase a través de un tubo con una cámara de enfriamiento adyacente. Hay de varios tipos, rectos, de rosario, serpentín, entre otros. | ||
Embudo cónico | Sirven para filtrar, trasvasar líquidos o sólidos con seguridad a otros recipientes. | ||
Embudo de separación (decantación) | Este embudo es utilizado para extracciones líquido-líquido para separar los componentes de una mezcla en dos fases inmiscibles de diferentes densidades. | ||
Embudo buchner | Es utilizado durante la filtración al vacío, puede ser de cristal o porcelana. | ||
Matraz de Filtración (Kitazato) | Es un matraz reforzado con adaptador para vacío. Es utilizado para filtrar al vacío |